Teenage Mutant Ninja Turtles

עמוק בתוך האדמה, מתחת לרחובות ניו-יורק הסואנים, יושבים להם ארבעה צבים מסביב לשאריות של מגש פיצה. בדרך כלל התכנסות שכזו היא סיבה למסיבה עבור ארבעת הצבים, אך לא הפעם. רק לפני כמה שעות נחטפה חברתם הטובה וכתבת החדשות המפורסמת, אפריל אוניל, מטנדר החדשות שלה. החוטף המרושע והאויב המושבע של הצבים, שרדר, מתכנן לצרף את אפריל המסכנה לחבורת הנינג'ות שלו, לא לפני שהוא יבצע לה שטיפת מוח ויסית אותה כנגד חבריה. כעת, צבי הנינג'ה מתכנסים בפעם האחרונה לפני שהם יוצאים לדרך, במטרה להציל את אפריל מידי שוביה.

את משימת ההצלה של אפריל, צבי הנינג'ה משלבים עם שתי משימות אחרות - חשובות לא פחות. הפעם, הצבים הולכים על כל הקופה, בניסיון לחסל את שרדר ולהחזיר את המאסטר שלהם, ספלינטר, מעכברוש לבנאדם. לשם כך, עליהם לעבור שישה שלבים מלאי אויבים בדמות נינג'ות ומוטציות, וכמובן - את שני הבריונים של שרדר - ביבופ ורוקסטדי. אולם, צבי הנינג'ה לא מגיעים בידיים ריקות - כל צב מחזיק בנשק המסורתי שלו, ובנוסף ניתן לאסוף נשקים במהלך השלבים השונים ולהשתמש בהם (בצורה מוגבלת) בעת הצורך. כל ארבעת הצבים משתתפים במסע, אך ניתן לשחק רק עם צב אחד בכל רגע נתון. כאשר הצב הנוכחי מובס, הוא נלכד על ידי אויביו ומוחזק במקום מסתור כלשהו. המשחק ממשיך עם אחד הצבים הנותרים (אם ישנם כאלה) והצב השבוי חוזר למשחק רק אם אחד מחבריו מצליח למצוא אותו.

המשחק כולל שני סוגי תצוגות - תצוגה עילית ותצוגה צדדית. התצוגה העילית מאפשרת לשחקן לסייר ברחבי שטח המשחק ולבחור את המקומות אליהם הוא רוצה להכנס, בעוד האקשן האמיתי בדרך כלל מסתתר בקטעים שמצריכים מעבר אל התצוגה הנגללת. בכל מקרה, לאונדרו, רפאל, מיכאלנג'לו ודונטלו כבר לא יכולים לחכות עם המשימה שלהם, ועכשיו הכל תלוי בכם...